学校学术氛围浓厚，科研工作深入扎实。在药物新剂型设计与评价、创新药物的合成与筛选、中药与天然药物药效物质基础和质量标准、药物代谢和药物动力学、药理与毒理学、药物经济学等领域的研究均居国内领先水平。

　　学校是国家中成药工程技术中心、沈阳国家新药安全性评价研究中心的重要组成单位，国家级平台1个，国家教育部重点实验室1个，国家发改委国家地方联合工程实验室1个，国家中医药管理局科研实验室和研究室6个，省级重点实验室(工程技术研究中心)24个，省级创新平台1个，省级协同创新中心1个，市级重点实验室(工程技术研究中心)12个。学校孕育了一大批新药创新成果，科学研究与应用实践密切结合，在医药行业和经济建设中发挥了重要作用，获得了巨大的经济效益和社会效益。

　　“十一五”以来，我校科研经费到款总计达到4.82亿元，共主持承担国家、省、市等各级各类课题903项，其中国家“863”、“973”国家重大科技专项、国家科技支撑计划、国家自然科学基金等国家级课题254项，纵向科研经费到款3.61亿元。SCI数据库检索论文3474篇，主编或参编图书163部，近五年发表SCI论文总被引用次数为7099次，篇均3.53次。